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    浪潮AI技术助力中国考古DNA实验

    信息来源:www.010inspur.com.cn | 发布时间:2019年08月02日

    浪潮AI技术助力中国考古DNA实验,对古人类的全基因组样本(WGS)分析时间,从原来的2周缩短到近9小时。北京浪潮服务器总代为你分享。


    神秘的古DNA研究是很难的,上下五千年,各民族在中华大地上生息繁衍、融合变迁,留下了很多未解之谜。为了解开这些谜团,考古学、民族学专家运用多种方法进行了探索。近年来兴起了一种新方法——古DNA技术,为考古研究提供了更加直接有力的证据,开辟了全新的视角。


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    北京浪潮服务器总代告诉大家,古DNA研究需要经过提取、扩增、测序等步骤,比现代DNA研究要难得多。特别是提取DNA分子非常困难,因为古生物没有特别的存储条件,在自然环境下,DNA完好地保存下来并不容易。DNA储存在细胞核内,生物体在死亡过程中,细胞就会逐渐发生自溶,DNA很快会被降解。另外,在高温和潮湿的条件下,DNA自身也容易发生水解、断裂。同时,即便有细胞保存下来也会碰到其它微生物的进驻,所产生的酶类也会把原细胞内的DNA破坏掉;因此,一般死亡的动物和人的遗体,DNA很难完整保存下来。


    之前做古DNA的测序数据处理一直是用台式工作站,一般完成一次古人类的全基因组样本分析需要耗时至少两周,过程中还要面临宕机带来的处理流程中断风险。


    浪潮为解决这一难题提供了新思路,作为中国AI计算的领军企业,浪潮专门为基因测序开发加速计算方案,经过严苛测试和全面考察,北京浪潮服务器总代告诉大家,浪潮已经在我国DNA考古领域的首个FPGA基因测序有了突破性的进展,提速39倍基因测序处理速度实现飞跃。

    北京浪潮服务器总代告诉大家,新的基因测序加速计算方案采用了浪潮研发的F10A FPGA加速卡作为核心计算模块,集成了峰科的GATK基因处理软件,可以适用于数据中心、边缘及桌面等各种复杂计算环境,每瓦特性能达到42GFlops,可以加载专业的软件算法库。


    浪潮的这一突破,加快了中国考古DNA的实验时间。从原来的2周缩短到近9小时。北京浪潮服务器总代告诉您,浪潮突破、研发AI智能技术,让浪潮在多个领域都可以发挥作用。